Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL5O76039 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms