Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB3O75712 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB3O75712 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB3O75712 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB3O75712 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB3O75712 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB3O75712 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB3O75712 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB3O75712 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB3O75712 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB3O75712 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB3O75712 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB3O75712 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB3O75712 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJB3O75712 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJB3O75712 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJB3O75712 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJB3O75712 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB3O75712 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB3O75712 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB3O75712 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB3O75712 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms