Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP5O75197 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP5O75197 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP5O75197 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP5O75197 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP5O75197 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP5O75197 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP5O75197 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP5O75197 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP5O75197 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRP5O75197 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP5O75197 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP5O75197 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP5O75197 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP5O75197 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP5O75197 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP5O75197 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP5O75197 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP5O75197 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP5O75197 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP5O75197 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP5O75197 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP5O75197 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP5O75197 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP5O75197 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP5O75197 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP5O75197 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP5O75197 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP5O75197 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP5O75197 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP5O75197 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP5O75197 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP5O75197 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP5O75197 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP5O75197 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP5O75197 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP5O75197 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP5O75197 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRP5O75197 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRP5O75197 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRP5O75197 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRP5O75197 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRP5O75197 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRP5O75197 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRP5O75197 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRP5O75197 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms