Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC22O60826 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC22O60826 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC22O60826 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC22O60826 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC22O60826 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC22O60826 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC22O60826 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC22O60826 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC22O60826 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC22O60826 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC22O60826 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC22O60826 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC22O60826 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC22O60826 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC22O60826 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC22O60826 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms