Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR5O60602 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR5O60602 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR5O60602 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR5O60602 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR5O60602 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR5O60602 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR5O60602 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR5O60602 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR5O60602 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR5O60602 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR5O60602 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR5O60602 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TLR5O60602 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR5O60602 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR5O60602 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR5O60602 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR5O60602 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR5O60602 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR5O60602 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR5O60602 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR5O60602 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR5O60602 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR5O60602 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR5O60602 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR5O60602 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR5O60602 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR5O60602 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR5O60602 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR5O60602 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR5O60602 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR5O60602 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR5O60602 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms