Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms