Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH6O60337 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms