Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP104O60308 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP104O60308 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP104O60308 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP104O60308 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP104O60308 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP104O60308 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP104O60308 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP104O60308 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP104O60308 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP104O60308 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP104O60308 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP104O60308 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP104O60308 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP104O60308 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP104O60308 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP104O60308 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP104O60308 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP104O60308 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP104O60308 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP104O60308 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP104O60308 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP104O60308 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP104O60308 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP104O60308 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP104O60308 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP104O60308 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP104O60308 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP104O60308 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP104O60308 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP104O60308 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP104O60308 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP104O60308 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP104O60308 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP104O60308 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP104O60308 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP104O60308 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP104O60308 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP104O60308 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP104O60308 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP104O60308 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP104O60308 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP104O60308 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms