Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EFNA2O43921 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EFNA2O43921 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms