Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXTL3O43909 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms