Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PRKAB2O43741 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms