Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTIFO43310 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTIFO43310 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTIFO43310 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTIFO43310 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTIFO43310 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTIFO43310 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTIFO43310 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTIFO43310 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTIFO43310 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTIFO43310 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTIFO43310 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTIFO43310 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTIFO43310 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTIFO43310 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTIFO43310 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTIFO43310 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTIFO43310 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTIFO43310 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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