Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 511.78□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 USP13-202ENST00000482333 1966 ntTSL 517.85■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 ACAP3-207ENST00000470659 421 ntTSL 313.16□□□□□ -0.32e-12■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 RNF149-202ENST00000424632 2010 ntTSL 216.79■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 CHTF18-206ENST00000461268 814 ntTSL 513.67□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 STK24-206ENST00000481288 656 ntTSL 311.8□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 STK24-207ENST00000491878 547 ntTSL 411.64□□□□□ -0.553e-8■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 MXI1-206ENST00000442296 634 ntTSL 59.57□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 FOXN3-212ENST00000556541 388 ntTSL 39.1□□□□□ -0.953e-8■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 SETD5-225ENST00000488236 1320 ntTSL 56.29□□□□□ -1.43e-8■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 RALGAPA1-215ENST00000556839 1305 ntTSL 34.51□□□□□ -1.693e-8■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 RALGAPA1-209ENST00000554652 4487 ntTSL 24.31□□□□□ -1.723e-8■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 FOXN3-216ENST00000557496 228 ntTSL 50.81□□□□□ -2.283e-8■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 NR1H4-201ENST00000188403 1630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 NR1H4-209ENST00000551379 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 28.6
RBFOX2O43251 GPX4-208ENST00000592940 1184 ntTSL 517.42■□□□□ 0.387e-8■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 GPX4-203ENST00000585480 501 ntTSL 211.49□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 GPX4-204ENST00000587648 536 ntTSL 27.15□□□□□ -1.267e-8■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 NRIP1-205ENST00000637630 573 ntTSL 39.54□□□□□ -0.887e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 NRIP1-207ENST00000638122 543 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 NRIP1-206ENST00000637963 498 ntTSL 47.39□□□□□ -1.237e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.993e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 INPP5A-204ENST00000423490 416 ntTSL 54.74□□□□□ -1.653e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-202ENST00000537450 1318 ntTSL 214.84□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-208ENST00000563428 2531 ntTSL 213.46□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-204ENST00000544090 2747 ntTSL 213.07□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-217ENST00000566903 2628 ntTSL 512.84□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-212ENST00000564774 4637 ntTSL 211.37□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.763e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-218ENST00000567759 3879 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 TAF1C-209ENST00000564208 3810 ntTSL 29.26□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 28.5
RBFOX2O43251 ZNF362-203ENST00000483388 712 ntTSL 217.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 ZNF362-204ENST00000490959 197 ntTSL 57.27□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 STK24-205ENST00000444574 1590 ntTSL 1 (best)11.79□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 STK24-204ENST00000418038 2172 ntTSL 211.53□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 STK24-202ENST00000376554 3602 ntTSL 59.04□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.795e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 521.68■■□□□ 1.065e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.265e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 NPHP4-206ENST00000468253 781 ntTSL 215.73■□□□□ 0.115e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.084e-15■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 NPHP4-209ENST00000489180 5548 ntTSL 214.93□□□□□ -0.025e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 TCERG1-207ENST00000507175 1984 ntTSL 214.85□□□□□ -0.035e-8■■■■■ 28.4
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RBFOX2O43251 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.155e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.294e-15■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 AES-209ENST00000587393 1082 ntTSL 212.84□□□□□ -0.355e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 AP2A1-206ENST00000600199 2381 ntTSL 512.67□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.395e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 211.84□□□□□ -0.515e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 USP36-221ENST00000592231 2479 ntTSL 211.68□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 28.4
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RBFOX2O43251 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.665e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 USP36-207ENST00000587010 607 ntTSL 310.78□□□□□ -0.685e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 WDTC1-203ENST00000447062 3115 ntTSL 210.77□□□□□ -0.694e-15■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 AES-212ENST00000592414 3274 ntTSL 210.21□□□□□ -0.775e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 USP36-208ENST00000587379 606 ntTSL 37.9□□□□□ -1.145e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 USP36-219ENST00000591052 427 ntTSL 37.75□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 USP36-211ENST00000588130 602 ntTSL 26.54□□□□□ -1.365e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 AES-211ENST00000592330 275 ntTSL 51.81□□□□□ -2.125e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 MXD4-203ENST00000513372 4228 ntTSL 211.81□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 MXD4-204ENST00000513380 624 ntTSL 59.57□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 ZGPAT-211ENST00000484569 749 ntTSL 213.55□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 EIF3B-207ENST00000465670 2766 ntTSL 212.28□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 MAN2C1-220ENST00000564785 4820 ntTSL 511.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 28.4
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