Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHADO15335 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHADO15335 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHADO15335 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHADO15335 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHADO15335 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHADO15335 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHADO15335 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHADO15335 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHADO15335 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHADO15335 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHADO15335 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHADO15335 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHADO15335 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHADO15335 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHADO15335 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHADO15335 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHADO15335 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHADO15335 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHADO15335 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHADO15335 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHADO15335 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHADO15335 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHADO15335 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHADO15335 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHADO15335 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms