Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IKBKBO14920 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms