Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms