Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP3O14828 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms