Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDC80O14777 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC80O14777 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC80O14777 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC80O14777 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC80O14777 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC80O14777 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC80O14777 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC80O14777 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC80O14777 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC80O14777 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC80O14777 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC80O14777 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC80O14777 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC80O14777 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC80O14777 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC80O14777 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC80O14777 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC80O14777 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC80O14777 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC80O14777 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC80O14777 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC80O14777 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC80O14777 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC80O14777 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC80O14777 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC80O14777 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC80O14777 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC80O14777 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC80O14777 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC80O14777 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC80O14777 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC80O14777 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC80O14777 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC80O14777 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC80O14777 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC80O14777 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC80O14777 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC80O14777 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC80O14777 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDC80O14777 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDC80O14777 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDC80O14777 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDC80O14777 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC80O14777 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms