Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC9O14530 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms