Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE40O14503 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms