Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRIT1O00522 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRIT1O00522 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KRIT1O00522 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRIT1O00522 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRIT1O00522 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRIT1O00522 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms