Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms