Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ERVV-1B6SEH8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms