Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3CLB5ME19 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF3CLB5ME19 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms