Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms