Protein–RNA interactions for Protein: A7E2V4

ZSWIM8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM8A7E2V4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM8A7E2V4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM8A7E2V4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
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