Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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