Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NNZ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NNZ2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNZ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NNZ2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NNZ2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NNZ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NNZ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NNZ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NNZ2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A6NNZ2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A6NNZ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNZ2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNZ2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNZ2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNZ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNZ2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNZ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNZ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNZ2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNZ2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNZ2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNZ2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNZ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNZ2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNZ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNZ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNZ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNZ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNZ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNZ2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNZ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNZ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms