Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC69A6NI79 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms