Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms