Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TARSL2A2RTX5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TARSL2A2RTX5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TARSL2A2RTX5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TARSL2A2RTX5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TARSL2A2RTX5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms