Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMD3A2A2Y4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms