Protein–RNA interactions for Protein: A0A576

TCRBV9S1A1T, T-cell receptor beta variable 3-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV9S1A1TA0A576 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TCRBV9S1A1TA0A576 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TCRBV9S1A1TA0A576 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TCRBV9S1A1TA0A576 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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TCRBV9S1A1TA0A576 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TCRBV9S1A1TA0A576 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV9S1A1TA0A576 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TCRBV9S1A1TA0A576 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TCRBV9S1A1TA0A576 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TCRBV9S1A1TA0A576 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TCRBV9S1A1TA0A576 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TCRBV9S1A1TA0A576 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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