Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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TCRBV7S3A2A0A539 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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TCRBV7S3A2A0A539 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
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TCRBV7S3A2A0A539 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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TCRBV7S3A2A0A539 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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TCRBV7S3A2A0A539 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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