Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF7

LOC100131303, HCG1775037, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC100131303A0A0U1RQF7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOC100131303A0A0U1RQF7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms