Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X0T9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms