Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CLP1-205ENST00000533682 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IL4R-201ENST00000170630 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LAMP5-201ENST00000246070 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KIAA1324-203ENST00000369939 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MIER1-207ENST00000371018 3875 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SPRY4-201ENST00000344120 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 STAT2-201ENST00000314128 3259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL441943.2-201ENST00000421077 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL137145.1-201ENST00000391437 2447 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AP000552.1-201ENST00000447720 3215 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DLD-201ENST00000205402 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZDHHC22-201ENST00000319374 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ATAT1-201ENST00000318999 2611 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 APTX-215ENST00000468275 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KCNMA1-246ENST00000638848 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SEC14L1-227ENST00000591437 2828 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MATN1-201ENST00000373765 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IP6K2-219ENST00000446860 1565 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 YME1L1-207ENST00000477432 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DNAJA2-201ENST00000317089 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ANKRD20A4-201ENST00000357336 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KCNH8-201ENST00000328405 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 C10orf67-201ENST00000323327 2799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ADGRG1-266ENST00000568908 3852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 USP6NL-202ENST00000379237 4546 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SLC44A3-204ENST00000467909 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PSPN-202ENST00000597721 3911 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LYSMD3-204ENST00000509384 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PSAPL1-201ENST00000319098 4680 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TSTD2-201ENST00000341170 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 HS6ST2-202ENST00000370836 4441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL160286.1-201ENST00000427215 2471 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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