Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
V9GY48 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
V9GY48 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
V9GY48 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
V9GY48 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
V9GY48 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
V9GY48 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
V9GY48 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
V9GY48 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
V9GY48 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
V9GY48 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
V9GY48 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
V9GY48 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GY48 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GY48 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GY48 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GY48 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GY48 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GY48 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GY48 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GY48 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GY48 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GY48 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GY48 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
V9GY48 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
V9GY48 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GY48 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
V9GY48 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
V9GY48 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
V9GY48 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
V9GY48 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
V9GY48 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
V9GY48 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
V9GY48 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
V9GY48 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GY48 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms