Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms