Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
WASHC2CQ9Y4E1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
WASHC2CQ9Y4E1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
WASHC2CQ9Y4E1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms