Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCAF1Q9Y4C2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms