Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB1Q9Y478 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms