Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9Y3F1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms