Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP7AQ9Y3A4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms