Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP11Q9Y3A2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UTP11Q9Y3A2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP11Q9Y3A2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms