Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIAA1024Q9UPX6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms