Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ABCG2Q9UNQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCG2Q9UNQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms