Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX6Q9UNH7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.9 ms