Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNPO2Q9UMS6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.1 ms