Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI3Q9ULW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PADI3Q9ULW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI3Q9ULW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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